A luta em defesa das pautas da população LGBTI+ é uma das marcas da atuação política de Carla Ayres. Na Câmara Municipal de Florianópolis, a vereadora aprovou três importantes leis: a que atualiza o Dia Municipal do Orgulho Gay para o Dia Municipal do Orgulho LGBT+; a que cria a Medalha Jenifer Célia Henrique, destinada a pessoas que defendem os direitos da população LGBTI+; e a que institui a Política Municipal de Atenção, Apoio e Acolhimento de Pessoas LGBTI+ em Situação de Violência e/ou Vulnerabilidade.
Além dessas, a vereadora Carla Ayres possui outras iniciativas em tramitação na Câmara Municipal, como o projeto de Empregabilidade Trans, que reserva um percentual mínimo de 2% das vagas em empresas que firmarem contrato com o Poder Público Municipal para essa população; o Projeto de Lei Luana Barbosa, que institui o Dia Municipal de Enfrentamento ao Lesbocídio; e a proposta que cria a Política Municipal de Saúde Integral de Lésbicas, Gays, Bissexuais, Pessoas Não Binárias, Intersexo, Transgêneros, Travestis e Transexuais (LGBTI+).
Enquanto deputada federal, Carla Ayres também teve forte atuação na defesa dos direitos da população LGBTI+. A parlamentar apresentou o projeto que dispõe sobre a desmedicalização dos corpos de pessoas intersexo e a proibição de cirurgias estéticas em crianças intersexo ou com genitália indiferenciada ou atípica; o que estabelece o Dia Nacional de Enfrentamento ao Lesbocídio – Lei Luana Barbosa; o que cria o Conselho Nacional dos Direitos das Pessoas Lésbicas, Gays, Bissexuais, Travestis, Transexuais, Queer, Intersexo, Assexuais e de outras identidades e orientações – LGBTQIA+; além de uma alteração do Código Penal, para incluir o lesbocídio como circunstância qualificadora do crime de homicídio e o estupro corretivo lesbofóbico como causa de aumento de pena no crime de estupro.
Para além dos projetos apresentados, a vereadora Carla Ayres apoiou uma série de iniciativas ao longo de seu mandato, como o Projeto Transvivência, que promoveu saúde, cidadania, cultura e direitos das pessoas trans, travestis e não binárias por meio de diversos serviços públicos; e o Encontrans Floripa, que promove a cultura, as vivências e as trocas de experiências dessa população.
Tanto na Câmara Municipal quanto na Câmara Federal, Carla Ayres buscou incluir a população LGBTI+ no debate público. Ao longo de sua atuação, promoveu diversas audiências e reuniões para discutir projetos, tratar de temas relevantes e evidenciar as principais pautas relacionadas a essa população.